En un contraste o prueba de hipótesis, la hipótesis alternativa o hipótesis alterna (Ha o H1) es aquella hipótesis estadística que se contrapone a la hipótesis nula para decidir sobre la aceptación o rechazo de la hipótesis nula. Frecuentemente, la hipótesis alternativa se establece como disyuntiva a la hipótesis nula, es decir como su opuesta, de forma que la aceptación de la aceptación de la hipótesis nula supone implícitamente el rechazo de la hipótesis alternativa y viceversa. De este modo, no suele ser necesario explicitar la hipótesis alternativa en la práctica, si se utiliza una notación adecuada para la hipótesis nula que fije claramente qué tipo de contraste debemos llevar a cabo. En cambio, la consideración de la hipótesis alternativa sí es importante para toda la teoría estadística en relacion a la optimalidad de los contrastes.
En la práctica, la hipótesis alternativa indica lo que se quiere realmente probar o afirmar, mientras que la hipótesis nula representa justamente lo contrario, es decir, lo que se quiere rechazar a la luz de los datos, para poder en consecuencia afirmar la hipótesis alternativa. Por ejemplo, si se piensa que los hombres y mujeres tienen diferente productividad en una tarea, se tomará como hipótesis nula justamente lo contrario, es decir, que ambos sexos tienen la misma productividad, mientras que la hipótesis alternativa vendrá dada por la desigualdad entre sexos, que es lo que se quiere demostrar, pero rechazando para ello la hipótesis nula, que es la que se toma como punto de partida.